Pengurusan hal ehwal Islam di Perlis mempunyai sejarah yang mendalam, bermula sejak zaman pemerintahan Siam dan Inggeris. Penubuhan Majlis Agama Islam Perlis (MAIPs) pada tahun 1920 oleh Almarhum Tuanku Syed Alwi Ibni Almarhum Syed Saffi Jamalullail merupakan langkah penting dalam perjalanan ini. Selepas Perlis menyertai Persekutuan Tanah Melayu pada tahun 1948, MAIPs distruktur semula untuk selari dengan pemerintahan negeri di bawah pimpinan Almarhum Tuanku Syed Putra Ibni Almarhum Syed Hassan Jamalullail, Raja Perlis ke-6. Sejak itu, peranan MAlPs adalah untuk menegakkan ajaran Islam selaras dengan Perlembagaan Negeri, di mana kepimpinan Yang DiPertua memainkan peranan penting dalam kejayaannya, dari Allahyarham Haji Ahmad Bin Muhammad sehingga ke DYMM Tuanku Syed Sirajuddin Ibni Almarhum Tuanku Syed Putra Jamalullail, dan kini, DYTM Tuanku Syed Faizuddin Putra Ibni Tuanku Syed Sirajuddin